各有关学院、部门：

根据国家自然科学基金委员会网站通知，2026年度专项项目“人工智能驱动的疾病相关肠道微生态失衡识别与因果机制研究”项目指南已发布，现将有关事项通知如下：

一、科学目标

建立规范化纵向的重点疾病肠道微生态—宿主表型资源，发展面向高维、组成性、异质性和多模态数据的可信AI 与因果推断方法；识别跨队列稳健且具有临床增量价值的菌株/功能/代谢标志物组合，验证关键微生态失衡单元影响肠屏障、免疫和远端器官损伤的因果链条，为风险预警、患者分层与靶向干预提供科学依据。

二、拟解决的核心科学问题

识别可重复、可解释、可验证和可干预的结直肠癌和糖尿病等代谢性疾病相关微生态失衡单元；建立“纵向人群发现-AI 与因果推断-机制验证-前瞻评价”的证据链；形成重点病种微生态图谱、原创方法、候选标志物谱和干预靶点。

科学问题1：疾病相关微生态失衡的最小可解释单元是什么？

是物种、菌株、基因功能、代谢通路、多界网络，还是其动态组合？如何区分疾病共性“炎症生态型”和病种特异信号？

科学问题2：如何在强混杂和跨队列偏移下识别稳健信号？

如何处理组成性、稀疏性、绝对菌量、地域、饮食、药物、排便性状、测序批次和共病等影响，使AI 模型在广泛人群中保持校准与可解释性？

科学问题3：如何将群体关联转化为个体可用信息？

微生态标志物能否在常规临床因素之上改善早筛、进展、复发及疗效/毒性预测？哪些人群和时间窗口最有临床价值？

科学问题4：哪些失衡是疾病驱动因素，而非疾病后果？

如何利用时间先后、剂量—效应、自然实验、遗传工具、负对照和干预证据，识别必要性、充分性与可逆性，并避免反向因果？

科学问题5：肠道局部信号如何传递至远端器官？

关键路径是屏障破坏、微生物易位、免疫细胞重编程、代谢物/微生物分子进入循环，还是神经-内分泌轴？其宿主受体、细胞类型和组织空间位点是什么？

鼓励申请人积极开展跨学科合作研究，申请书研究内容要紧密围绕项目指南中拟解决的核心科学问题，同时应具有显著的AI 与肠道微生态交叉融合特点，形成方法学创新与基础研究互补的研究范式。

三、资助计划

本专项项目直接费用总额度约为2000万元。拟资助8-10项，直接费用资助强度约为200-300万元/项，每个项目针对一个或多个科学问题开展探索性研究。项目资助期限为3年，申请书中的研究期限应填写“2027年1月1日-2029年12月31日”。

四、申请要求及注意事项

（一）申请人条件。

1. 具有承担基础研究课题的经历。

2. 具有高级专业技术职务（职称）。

在站博士后研究人员、正在攻读研究生学位以及无工作单位或者所在单位不是依托单位的人员不得作为申请人进行申请。

3. 鼓励45 岁以下的青年科研人员申请。

（二）限项申请规定。

1. 本专项项目申请时不计入高级专业技术职务（职称）人员申请和承担总数2 项的范围；正式接收申请到国家自然科学基金委员会作出资助与否决定之前，以及获得资助后，计入高级专业技术职务（职称）人员申请和承担总数2 项的范围。

2. 申请人和主要参与者只能申请或参与申请1项本专项项目。

3. 申请人同年只能申请1 项专项项目。

（三）申请注意事项。

1. 申请人应当认真阅读并执行本项目指南、《2026 年度国家自然科学基金项目指南》和《关于2026年度国家自然科学基金项目申请与结题等有关事项的通告》中相关要求，不符合项目指南和相关要求的申请项目不予受理。

2．本专项项目实行无纸化申请。申请人完成申请书撰写后，在线提交电子申请书及附件材料。申请书提交校内接收截止日期为10月26日，请申请人提前与科技处联系确认申报具体事项，逾期不予受理。

3．申请人应围绕本指南公布的拟解决的核心科学问题撰写申请书，具体阐述拟开展的研究内容、方案及资金预算，不符的项目不予受理。

4. 申请书中的资助类别选择“专项项目”，亚类说明选择“研究项目”，附注说明选择“科学部综合研究项目”，申请代码选择“C01”。以上选择不准确或未选择的项目申请将不予受理。 

5. 申请人应当按照专项项目申请书的撰写提纲撰写申请书。请在申请书正文开头注明“2026 年度专项项目-人工智能驱动的疾病相关肠道微生态失衡识别与因果机制研究：***”，并说明本申请项目对应的项目指南拟解决核心科学问题的编号和名称，如“本申请项目对应专项项目指南中科学问题1：疾病相关微生态失衡的最小可解释单元是什么”。申请书应突出有限目标和重点突破，明确对实现本专项项目总体科学目标和解决核心科学问题的贡献。

6. 如果申请人已经承担与本专项项目相关的其他科技计划项目，应当在申请书正文的“研究基础与工作条件”部分论述申请项目与其他相关项目的区别与联系。

7. 2026年度专项项目“人工智能驱动的疾病相关肠道微生态失衡识别与因果机制研究”项目指南已通过科学基金网络信息系统（https://grants.nsfc.gov.cn）发布，请申请人登录科学基金网络信息系统，在“项目管理-项目指南”模块查看，按项目指南所述要求和注意事项申请。

未尽事宜，请与科学技术处科技计划与军工项目科杨晓明、薛也联系，电话：85012139，我们将热忱为您服务。

科学技术处

2026年9月22日